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utilisation du scanner à plat en classe ou au laboratoire

mis à jour le 27/09/2009


drosophiles_mesurim

Le scanner à plat peut être utilisé pour de nombreuses numérisations d'objets biologiques et géologiques

mots clés : scanner, image numérique, Tice, mesurim


Utilisations possibles

scannerLe scanner à plat permet de réaliser une grande variété d'images numériques de bonne qualité. Pour les objets de grande taille, ils devront disposer d'une surface plane. Pour les petits objets (jusqu'au mm), ils devront être placés directement sur la vitre ou dans un support transparent plat (type boîte de Pétri). La qualité de l'image réalisée pour les objets de petite taille dépendra de la résolution optique maximale du scanner.

Au lycée, il peut être utilisé pour scanner des populations de drosophiles, des colonies de levures, des échantillons de roches dont une face a été polie, des lames de roches et bien sûr des chromatographies, des électrophorèses...












Les logiciels pour piloter le scanner

 
scanner01Plusieurs modes d'utilisation sont souvent proposés. Le plus simple, c'est le logiciel qui gère tout, qui reconnait donc le type d'objet et qui optimise automatiquement la réalisation de l'image. Le problème est que parfois le résultat n'est pas adapté à l'utilisation souhaitée.
scanner02
Pour ce logiciel le deuxième mode ("mode loisir") semble plus indiqué, il  permet de faire un aperçu, et donc de délimiter la zone de l'objet qui doit être scannée et de choisir la résolution optique.
 
scanner03Un tableau de paramétrage est alors présenté
 
Remarque : le lancement du logiciel de pilotage peut se faire directement à partir de MESURIMscanner05
Pour choisir la source, sélectionner le scanner que vous utilisez.
scanner06
Pour lancer l'acquisition faire Fichier/Acquérir. L'interface de paramétrage et de pilotage du scanner apparaît sur l'écran.scanner07
 

Le choix de la résolution optique à utiliser

C'est l'étape la plus délicate qui devra éventuellement faire l'objet de plusieurs essais.

La résolution est exprimée en dpi (ou ppp) et elle relie le nombre de pixels de l'image à sa taille réelle.

Elle donne le nombre de Pixels qui seront présents sur l'image Par Pouce.

1 pouce = 2,54cm

Plus le nombre de Pixels Par Pouce sera grand plus la résolution sera grande.
Une conséquence évidente pour l'utilisation du scanner : plus l'objet a scanner sera petit plus il faudra utiliser une résolution optique importante.
droso06 
 droso50 droso100
 50 dpi
 100 dpi
 droso300 droso1200
 300 dpi
 1200 dpi
 

Quelques utilisations possibles


scanner04Dans cet exemple pour un objet qui fait un ou 2 mm, il faut une résolution optique de l'ordre de 1000 dpi (voire plus) si l'on veut pouvoir utiliser cette image par exemple pour faire un comptage des différents phénotypes avec Mesurim.
 
scanner08On peut aussi souhaiter avoir des informations sur la taille réelles des drosophiles ou de certains organes.
Le choix de la résolution définit l'échelle de l'image. Ici, il y aura donc 1200 Pixels Par Pouce c'est à dire sur une longueur de 2,54 cm.
Mesurim peut intégrer ces données et permet, en indiquant la résolution choisie de faire très rapidement des mesures sur l'image.
scanner09
 

Automatisation du fonctionnement du scanner

Il est possible d'automatiser le fonctionnement du scanner, c'est à dire de paramétrer le déclenchement du scanner à intervalles de temps réguliers .
Un logiciel a été mis au point pour cela par J.F MADRE : Seriscan
Le logiciel est, en principe, compatible avec les scanners à plat répondant à la norme Twain

Précautions d'emploi

Attention, la vitre est fragile, elle peut se rayer et  devra être soigneusement nettoyée. Pour la protéger, on peut utiliser un film transparent pour rétroprojecteur.

La partie mécanique de cet outil est elle aussi fragile. Les déplacements ne sont donc pas conseillés. Si un déplacement exceptionnel doit être réalisé, penser à utiliser le "verrou de transport".
 
auteur(s) :

Frédéric Roux, professeur de SVT au lycée du pays de Retz à Pornic

information(s) pédagogique(s)

niveau : tous niveaux

type pédagogique : tutoriel, travaux pratiques

public visé : enseignant

contexte d'usage : classe, laboratoire, salle multimedia

référence aux programmes :

ressource(s) principale(s)

vignette stomate numérisation d'images en SVT, dispositifs et usages 18/09/2009
Ce guide tente de faire le point sur les appareils et les usages qui facilitent l'acquisition et le traitement des images par les élèves.
Appareils photos numériques, caméra, vidéomicroscopie, scanner, image numérique, mesurim, Tice Frédéric Roux; François Cordellier

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